液相色譜柱效受柱內外因素影響，為使色譜柱達到佳效率，除柱外死體積要小外，也要有合理的柱結構（盡可能減少填充床以外的死體積）及裝填技術。即使好的裝填技術，在柱中心部位和沿管壁部位的填充情況總是不一樣的，靠近管壁的部位比較疏松，易產生溝流，流速較快，影響沖洗劑的流形，使譜帶加寬，這就是管壁效應。

　　為提高分析靈敏度，與質譜（MS）聯接，而發展出窄徑柱、毛細管柱和內徑小于0.2mm的微徑柱（MICROBORE）。細管徑柱的優點是：①節省流動相；②靈敏度增加；③樣品量少；④能使用長柱達到高分離度；⑤容易控制柱溫；⑥易于實現LC－MS聯用。

　　影響液相色譜柱性能的物理因素分別有下面這些：

　　(1)硅膠純度

　　硅膠純度和殘留金屬離子濃度，硅膠的雜質會影響化合物的峰形，硅膠表面的金屬含量高會影響堿性化合物的峰形，易發生拖尾。

　　(2)色譜柱尺寸

　　填料床的長度和內徑，增加色譜柱長度，可以在一定程度上提高柱效，但也會升高壓力和導致峰展寬；寬柱徑，提高載樣量，但也會增加橫向擴散，同樣會導致峰展寬。窄柱徑可以節約溶劑，可減少橫向擴散，但壓力較大，對系統要求較高。

　　(3)顆粒形狀及粒徑

　　球形顆粒柱效高、重現性好、柱床結構均勻，不規則形柱床結構不均勻、流動相線速度不均勻，容易譜帶展寬；平均顆粒直徑，粒徑越小，柱效越高，柱壓也越高。粒徑分布越廣則柱效越低，壓力越大。

　　(4)顆粒表面積

　　顆粒外表面和內部孔表面的總和，以m2/g表示，相對而言高表面積對樣品具有較強的保留能力，更大的液相色譜柱柱容量和分離度。而低表面積能更快達到平衡狀態，更適合梯度洗脫程序。

　　(5)孔徑

　　顆粒的孔或腔的平均尺寸，范圍是80~300?，大孔徑的填料顆?？梢匝娱L大分子溶質在填料表面的滯留時間，改善分離，所以大孔徑填料適合分離大分子化合物或者水動力體積較大的分子。